合资企业年检跟独资企业年检的性质不一样，合资企业年检相对来说就比较麻烦。因为汇算清缴报告对公窗口是税务局的，去的地方不一样，所以提交的材料也不一样，就拿年检报告来说就有四种。
中外合资经营企业是由中国投资者和外国投资者共同出资、共同经营、共负盈亏、共担风险的企业。外国合营者可以是企业、其他经济组织或个人。中国合营者目前只限于企业、其他经济组织，不包括个人和个体企业。经审查机关批准，合营企业是中国法人，受中国法律的管辖和保护。它的组织形式是有限责任公司。参加合资企业年检的企业应在规定的时限内先到工商行政管理机关企业年检主管部门领取《年检报告书》。领取合资企业年检报告书时，应携带本企业营业执照副本。合资企业年检主管部门应当对已领取《年检报告书》的企业登记注册，掌握所辖企业数与已领取年检报告书企业数的比例，以便及时掌握年检进程。与此同时，应及时与未领表企业进行联系，督促企业参加年检。目前国家工商行政管理局制定的《年检报告书》有四种，适用于不同类型的企业。
合资企业年检基本流程：企业申领、报送年检报告书和其他有关材料；登记主管机关受理审核年检材料；企业交纳年检费；登记主管机关加贴年检标识和加盖年检戳记；登记主管机关发还企业营业执照。
